，PEEK本身通被認為是生物相容，這意味著它于正常狀況下不會直接對人體造成傷害。然而，于特定條件下，如高溫或極端環境中，PEEK也許會釋放出微量單體或其他降解產物。這些物質也許引起皮膚刺激、呼吸道不適或過敏反應，尤其是對于那些對聚合物敏感人群。
一直暴露于PEEK粉塵中也許導致健康問題。于生產過程中，如果缺乏適當防護措施，工人也許會吸入PEEK粉末。這也許導致呼吸道炎癥或更嚴重呼吸系統疾病。因此，工作場所應配備很好通風系統、防塵設備，并要求員工佩戴適當個人防護裝備。
另外，雖然PEEK植入物于醫學上被證明是安全，但任何植入手術都有潛于風險。例如，植入后也許有排異反應或感染。盡管這種狀況較為罕見，但仍需密切監測患者術后狀況。
上述概括起來雖然聚醚醚酮于許多行業表現突出，但于使用時仍需注意其潛于健康風險。無論是生產還是醫療用途，采取適當安全措施都是必不可少。
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