，PEEK價格高昂是其一大劣勢。因為生產過程復雜且技術門檻高，PEEK樹脂成本遠高于普通塑料，這使得其于一些對成本敏感用途場景中難以普及。例如，于大規模生產或一次性消費品行業，使用PEEK也許并不經濟。
盡管PEEK具有優良耐磨性、低摩擦系數，但于某些極端工況下，其表面硬度較低問題會顯現出來。這意味著于高接觸應力或頻繁摩擦狀況下，PEEK部件也許會有磨損或劃痕，從而影響使用壽命。另外，PEEK韌性雖然較好，但于低溫環境下其沖擊強度會顯著下降，這限制了它于極寒區用途。
：PEEK加工難度較大也是一個不容忽視問題。因為其熔融粘度較高，要較高加工溫度、壓力，這對設備要求更高。和此同時，不恰當加工參數也許導致產品內部應力集中或尺寸精度不足，進而影響最終產品性能。
上述概括起來雖然聚醚醚酮含諸多優秀特性，但其高昂成本、特定環境下性能局限還有復雜加工要求仍是制約其大量用途很大因素。于選擇材料時，必須綜合考慮這些因素以確保最佳用途效果。
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