，于化學結構上，PTFE是由單一四氟乙烯單體聚合而成，而FEP則是由四氟乙烯、六氟丙烯兩種單體共聚得到。這種不同結構導致了它們于熱穩固性上區別。PTFE具有極高耐熱性，可于260℃下一直使用，并且于短時間內能承受高達300℃溫度，表現出優秀熱穩固性。相比之下，FEP熔融溫度較低，通常于250260℃之間，這使得它更適合于要熔融加工用途場景。
從機械性能來看，FEP比PTFE更柔軟、更具彈性，因此于某些要優良柔韌性場合中表現更為突出。另外，FEP介電性能優于PTFE，尤其是于高頻條件下，其介電常數、損耗因子都較小，這對工業中高頻電纜不導電材料選擇非常很大。
于加工方式上，兩者也有很大不同。PTFE因為分子鏈剛性、結晶度較高，難以通過傳統熱塑性塑料方法進行加工，通常采用燒結成型特殊工藝；而FEP則可以像普通熱塑性塑料一樣被擠出或注塑成型，從而大大簡化了生產流程并降低了成本。
盡管如此，PTFE仍然以其超強化學惰性、低摩擦系數著稱，于防腐蝕設備、密封件行業占據主導位。而FEP憑借其特殊加工特性、優良綜合性能，于電線電纜護套、涂層還有微波通信方面得到了大量用途。這兩種材料各自擁有特殊優勢，于不同行業發揮著不可替代作用。
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