，從化學結構來看，PFA是由四氟乙烯、全氟烷基乙烯基醚共聚而成，而PTFE則是由四氟乙烯均聚得到。這種細微結構差異導致了它們不同物理特性。PFA具有更高熔融流動性，這使得它更容易加工成型，適合用于生產復雜形狀零件。相比之下，PTFE因為其分子鏈高度規整性、結晶度，表現出極高耐化學性、低摩擦系數，但它較難加工，通常要預成型后燒結。
于使用溫度方面，PFA工作溫度范圍為200°C至+260°C，而PTFE則可達200°C至+250°C。雖然兩者都能承受極端低溫，但于高溫下PFA顯現出更好機械強度保持率，這對于某些工業用途來說至關很大。
另外，PFA以其優秀透明度著稱，這對那些對外觀有要求用途場合非常有利；而PTFE通常是不透明。于電氣不導電性能上，兩者都非常突出，但PFA因為更好加工性，于一些精密元件中更受歡迎。
上述概括起來選擇PFA還是PTFE取決于具體用途需求。如果要優良加工性能、高透明度，則PFA是更好選擇；若追求極致耐化學性、低摩擦系數，則PTFE也許是更合適選擇。
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